一、背景和意义
随着信息技术与互联网的飞速发展,大量药学信息资源汇聚到网络之中。面对海量药学信息,亟待设计一个能够全面、系统、便捷、快速、准确提供药学信息的一站式服务系统[1]。特定疾病的数据库在国外早已有之,这些数据库往往采用数据挖掘等数据分析方法改善医院服务,对外提供信息。本研究针对乳腺癌,乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,国家癌症中心2012年公布的数据显示:乳腺癌是我国女性发病率最高的恶性肿瘤,占女性全部恶性肿瘤发病的16.81%,且发病率正在以每年3%~4%的速度猛增。然而与此同时乳腺癌的发病率和基因突变率,中国都低于欧美国家。然而美国检测机构使用的乳腺癌突变基因库中,来自亚裔的样本不超过6万例,如果用来研究亚洲人乳腺癌则不够准确。对于乳腺癌数据库,本研究旨在建立中国人自己的乳腺癌数据库。
鉴于此,基于web平台建立一个乳腺癌药学数据平台,将药物基本信息,靶点信息,临床数据进行整合,为国内医药学研究者提供数据支持。与此同时,对数据进行分析,对于药物相互作用数据进行挖掘,为国内药学要实现药学信息共享,能够助力国内乳腺癌研究,加快我国药学信息化的发展,在当今时代,具有重要意义。
二、国内外研究现状
当前,在医学卫生领域的数据处理分析过程中数据挖掘技术已取得了众多成果。[3]在国外医学领域中,己经有相当多的针对临床数据进行数据分析的研究。这些研究在大量数据中得出了一定的规律,取得了许多令人满意的成果[4]。如日本岛根大学的研究[5],其对整个医院的存储信息系统通过时间分类进行基于聚类的数据挖掘,通过多维度数据的聚类方法对病人的白蛋白和血小板数据分析,得到了最有可能患慢性肝炎的病例数据结论集,从而改善了医院的服务。在靶点数据方面,国外已经建立了很多靶点数据库[6]。如TTD:收集了2 000多个靶点信息,包括已有药物上市的药物靶点、正在研究的、临床试验阶段的、以及已停止的靶点信息;BindingDB:包括近百万个靶点酒己体结合信息,其中包括6000多个蛋白质靶点,并提供了它们已报道的配体的结构及生物活性信息。与国外药物靶点数据库相比较[6],国内的药物靶点数据库中的靶点尽管数据类别很多,但是数据信息更新与维护有待于提高此外,在数据形式多元化、数据可视化以及数据挖掘方面也略显不足,药物靶点数据库不应局限于数据的收集,应该通过数据挖掘来发现一些靶点与配体的作用规律。在药学数据库中,国外有关人类疾病信息的数据库主要是集中在一些特定的疾病分类[7],比如在Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)中存在的孟德尔病数据[8];在传染病生物标记物数据库中,记录了罕见的儿童疾病(http://www.madisonsfoundation.org/index.php);。其它的比如马来西亚国家心血管疾病数据库(NCVD)[9],对于心血管疾病做出了记录和总结。
三、理论依据、研究方法、研究内容
本系统采用 Microsoft Visual Studio 2010 为开发平台,SQL Server2008 为数据库,服务器端采用Internet Information Services(IIS,互联网信息服务)技术。本系统架构为三层架构,如下图所示[7]
四、任务分工:
1.药物相互作用分析(1人);
2.靶点信息的收集整理(1人);
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