课题背景：放线菌是抗生素的主要产生菌，盐碱环境具有高pH和高盐浓度，栖息其中的放线菌为适应这种逆境胁迫，代谢途径及相关基因通过千万年的演变，与普通环境放线菌有所不同，发现土著盐碱环境放线菌，并筛选其中抗生素，是目前国内外新抗生素研究领域的一个重要方面。
本研究以我国北方盐碱土及盐生植物根际土壤样品为研究对象，对从中发现分离的放线菌开展发酵、提取、浓缩和基于琼脂平板的抗菌活性测定，完成针对真菌、革兰氏阳性及阴性细菌、相应耐药菌的抗菌活性研究，为新抗生素发现奠定基础。
实验流程：1.1方法1.1.1样品的处理取从盐碱环境土壤及盐生植物根际分离所得放线菌与斜面保存，另取一部分该菌于改良ISP2加盐培养基上活化培养一周。
1.1.2菌落挑选与纯化分离平板在28℃培养4~6周，无菌条件下挑取单菌落于纯化平板上，作三区划线，将得到的纯培养物接种于斜面培养基上，待菌株生长好后，置于4℃冰箱中保存，同时，挑取长势良好的菌体于灭菌20%甘油水溶液内，于-80℃冰箱内低温保存。
1.1.3基于16S rRNA基因序列的系统发育多样性分析1.1.3.1基因组DNA的提取采用Chelex-100法 [1-2]提取基因组DNA。
1.1.3.216S rRNA的PCR扩增16S rRNA基因的PCR扩增与测序模板为上述提取的基因组DNA，引物为27f (5-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3)和1492r (5-TACGGCTACCTTGTTACGACTT-3)，50mu;LPCR反应体系：TaqSuperMix25?L;27f引物2.5?L;1492r引物2.5mu;L;模板2。
5mu;L;无菌水17.5mu;L。
PCR反应条件为：95℃预变性5min；94℃变性1min，55℃退火1min，72℃延伸2min，35个循环；最后72℃后延伸10min。
PCR产物用1 %琼脂糖凝胶电泳检测，Bio-RAD凝胶成像仪成像观察电泳结果。
1.1.3.3序列分析和系统发育树的构建将16S rRNA序列登陆数据库EzBioCloud中进行相似性比对搜索，以相似性较高且有效描述的典型菌株的16S rRNA序列作为参比对象，用Bio Edit[3]进行多序列比对，采用MEGA5.0[4]软件以邻接法(Neighbor-joining)[5]进行聚类分析和构建系统发育树，系统进化矩阵根据Kimura two parameter模型估计，同时，重复取样1000次进行自展值分析评估进化树的拓扑结构的稳定性。
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